Учени от Университета „Лудвиг Максимилиан“ в Мюнхен, Медицинския университет „Шарите“ в Берлин и Берлинския институт за фундаментални изследвания в областта на обучението с данни (BIFOLD) към Техническия университет в Берлин създадоха подробен атлас на рака на белия дроб, наречен LuCaS+.
Изследователите анализират туморна тъкан от 454 пациенти с рак на белия дроб, като използват едноклетъчно РНК секвениране. Методът позволява да се проследи активността на над 2000 гена във всяка отделна клетка. По този начин са изследвани повече от 2,5 милиона клетки.
С помощта на машинно обучение учените разграничават различни групи туморни клетки, както и клетки на имунната система, съединителната тъкан и кръвоносните съдове, които изграждат обкръжението на тумора.
Анализът разкрива кои групи туморни клетки са по-силно свързани с образуването на метастази. Изследователите установяват, че съчетаването на характеристиките на тумора и неговата микросреда позволява по-точно прогнозиране на хода на заболяването в сравнение с традиционните клинични показатели.
Моделът успява да открие пациенти в ранен стадий, при които рискът от метастази е по-висок от очаквания за този етап, както и пациенти с по-благоприятна прогноза. Резултатите са потвърдени и в независима група пациенти.
Според авторите атласът може да подпомогне идентифицирането на нови терапевтични мишени и разработването на по-персонализирани подходи за лечение. Тези възможности обаче предстои да бъдат проверени в допълнителни експерименти.
Проучването е публикувано в списание Nature Cancer.
Коментари